中国2004年至2018年的动物狂犬病监测(4)
Animal Rabies Surveillance, China, 2004–2018
在美国CDC于今年12月出书的专业杂志《Emerg Infect Dis.(新发感染病)》上揭晓了军事医学科学院军事兽医研究所(中国长春)涂长春研究员等的这篇研究论文提供了迄今为止最全面的中国RABV(狂犬病毒)熏染动物的种类、地理漫衍、流传源和遗传多样性的数据集。现将该论文的主要内容举行摘译此次公布的是第四部门:
效果3. 中国及周边国家动物狂犬病的流传
贝叶斯轮廓模型(Bayesian skyline model)分析的效果显示被测RABV的平均核苷酸替代率为每年每位点3.50×10-4替换(95%最高后验密度为每年每位点2.90–4.11×10-4替换)。这一发现与之前对狗相关RABV N基因的进化变化分析效果一致(25)。
分支和亚分支的演化速率差异不显著。中国与周边国家具有代表性的RABV均共享tMRCA(最近配合祖先时间)提示在349-563年前泛起汇合点(图4)。进一步用BEAST软件分析RABV亚分支的流传途径可以发现狂犬病在中国差别疆域地域发生了跨国界流传。与我们之前对G基因的分析效果一致我们再次确定了SEA1 (贝叶斯因子Bayes factor 76.9)从中国到印度尼西亚的意义重大的迁移途径(附录表4)(图5)(26)。
图4. 基于核卵白(N)基因的狂犬病毒最大进化分支可信度(credibility)树。标明晰这些分支预计的最近配合祖先时间(tMRCA)和它们95%最高后密度值(highest posterior density values
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